Dalam bidang penelitian, Program Studi Magister Farmasi Klinik memiliki misi untuk meningkatkan kuantitas dan kualitas penelitian dalam bidang farmasi klinik yang berwawasan global untuk menopang pendidikan, pengembangan ilmu dan teknologi, serta penerapannya di masyarakat, dan responsif terhadap permasalahan masyarakat, bangsa dan negara.
Prodi Magister Farmasi Klinik Fakultas Farmasi UGM menyusun road map penelitian dengan melibatkan stakeholder dan civitas akademika. Hal ini dimaksudkan untuk dapat menggunakan pendekatan dan pemikiran terkini dalam pemecahan permasalahan yang ada di masyakarat. Penelitian dosen dan mahasiswa Prodi Magister Farmasi Klinik dapat berupa penelitian mandiri maupun penelitian kerjasama dengan mitra, baik dari dalam maupun luar negeri. Penelitian yang dilakukan bisa berskala lokal, nasional, maupun internasional. Penelitian di bidang farmasi klinik melibatkan banyak stake holder, terutama rumah sakit dan tempat-tempat pelayanan kesehatan serta masyarakat, yang ditujukan untuk mendapatkan luaran konsep dan/atau rekomendasi kebijakan dan pelayanan kefarmasian (Pharmaceutical care) yang lebih optimum dan meningkatkan peran Apoteker Klinis dalam sistim pelayanan Kesehatan.
Road map penelitian Prodi Magister Farmasi Klinik dapat digambarkan sebagai berikut:
Target Riset Prodi Magister Farmasi Klinik Fakultas Farmasi
Tahap 1(2018 – 2019) : Penguatan Fondasi Riset Tahap ini meliputi pemantapan roadmap penelitian Prodi, memperkuat kemitraan untuk menunjang penelitian, meningkatkan kualitas sumber daya peneliti yang berkompeten, mendorong penelitian yang terkait dengan roadmap.
Tahap 2 (2020-2021) : Optimasi Riset Tahap ini meliputi penguatan kemitraan untuk menunjang penelitian, peningkatan kapasitas dosen dan mahasiswa dalam penelitian yang sesuai dengan roadmap, peningkatan jumlah publikasi nasional dan internasional, serta mendorong pembelajaran berbasis riset.
Tahap 3 (2022-2023) : Akselerasi dan Pemantapan Tahap ini meliputi penguatan kemitraan untuk menunjang penelitian, peningkatan kapasitas dosen dan mahasiswa dalam penelitian yang sesuai dengan roadmap dan menghasilkan risetriset unggul yang bisa dimanfaatkan kebijakan pelayanan kesehatan, peningkatan jumlah publikasi nasional dan internasional, serta memantapkan riset sebagai basis dalam pembelajaran.